BUSCO数据库包含物种

conda activate busco  ##激活busco
busco --list-datasets  ###查看可用的BUSCO数据库,查找目标物种属于哪个分类,分类越小越好

奈何很多物种名字不知道中文名字,我简单百度了一下,现列出真核生物包含的种类及中文翻译。

stramenopiles_odb10菌界
fungi_odb10真菌
ascomycota_odb10子囊菌门
basidiomycota_odb10担子菌门
mucoromycota_odb10毛霉门
saccharomycetes_odb10酵母纲
dothideomycetes_odb10座囊菌纲
eurotiomycetes_odb10散囊菌纲
leotiomycetes_odb10锤舌菌纲
sordariomycetes_odb10粪壳菌纲
mucorales_odb10毛霉目
boletales_odb10牛肝菌目
eurotiales_odb10散囊菌目
helotiales_odb10柔膜菌目
hypocreales_odb10肉座菌目
onygenales_odb10散囊菌目
pleosporales_odb10格孢腔菌目
polyporales_odb10多孔菌目
actinopterygii_odb10放线菌
agaricomycetes_odb10琼脂菌
agaricales_odb10伞菌
glomerellales_odb10炭疽病菌属
tremellomycetes_odb10植物银耳纲
viridiplantae_odb10植物绿色植物界
chlorophyta_odb10植物绿藻门
embryophyta_odb10植物有胚植物
eudicots_odb10植物真双子叶植物
liliopsida_odb10植物百合纲
brassicales_odb10植物十字花目
fabales_odb10植物豆目
poales_odb10植物禾本目
solanales_odb10植物茄目
microsporidia_odb10动物微孢子虫
nematoda_odb10动物线虫纲
alveolata_odb10动物囊泡虫类
plasmodium_odb10动物疟原虫属
euglenozoa_odb10动物眼虫门
arthropoda_odb10动物节肢动物门
insecta_odb10动物昆虫纲
arachnida_odb10动物蛛形纲
endopterygota_odb10动物全变态类
hemiptera_odb10动物半翅目
hymenoptera_odb10动物膜翅目
diptera_odb10动物双翅目
coccidia_odb10动物球虫
lepidoptera_odb10动物鳞翅目
mollusca_odb10动物软体动物门
aconoidasida_odb10动物无类锥体纲
apicomplexa_odb10动物顶复亚门
vertebrata_odb10动物脊椎动物亚门
metazoa_odb10动物后生动物
aves_odb10动物鸟纲
mammalia_odb10动物哺乳动物纲
eutheria_odb10动物真兽亚纲
cetartiodactyla_odb10动物鲸偶蹄类
primates_odb10动物灵长类
sauropsida_odb10动物蜥形类
tetrapoda_odb10动物四足类
capnodiales_odb10动物煤炱目
carnivora_odb10动物食肉目
chaetothyriales_odb10动物刺盾炱目
cyprinodontiformes_odb10动物 鳉形目
euarchontoglires_odb10动物灵长总目
eukaryota_odb10动物真核生物
glires_odb10动物啮类动物
laurasiatheria_odb10动物亚兽总目
passeriformes_odb10动物雀形目

发表回复

您的电子邮箱地址不会被公开。