如何利用MACS注释和可视化ChIP-seq结果

基因注释离不开转录因子和组蛋白修饰位点的研究。染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的最常用的工具。相对应的ChIP-seq是用ChIP技术将目标蛋白与染色质连结起来,然后用超声波打碎基因组,添加与目标蛋白特异结合的抗体,从而形成抗体、目标蛋白、结合DNA形成的沉淀免疫结合体,分离这些结合体,将DNA分子从结合体中洗下,纯化,然后进行深度测序,所得到的测序结果就是ChIP-seq。 继续阅读