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Original Papers
Protein signature-based estimation of metagenomic abundances including all domains of life and viruses
Bioinformatics published 15 February 2013, 10.1093/bioinformatics/btt077
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EMBOSS(European Molecular Biology Open Software Suite)欧洲分子生物学开放软件包，整合了目前大部分序列分析软件，可以进行序列转换，序列比对，序列翻译，酶切分析，引物设计，CpG岛分析等等等等，目前共有261个程序，程序使用也比较简单，根据需要挑选合适程序，设置恰当参数，调用就可以了。因为其软件开放，特别适合批量分析，可以根据自己的需要修改和调用，是生物信息中不可或缺的工具。不过需要注意的是由于版本的不同，或者开发者所处时代的局限性，有些软件开发得比较早，对于今天可能不再实用，所以不能都照搬，一定要做测试验证。还有一个问题是图形化界面不是太丰富。感兴趣的话可以下载。
miRNA命名，由miRBase制定了一系列规则。以hsa-mir-125b-2为例，前三个字母是物种代码， 继续阅读
在前面介绍了一些常见序列的accession号，其实在NCBI中还有很多accession号，仅与RNA相关的就有116种，这里各举一个例子供参考。不同的编码代号代表不同的意思，如NM_开头的表示标准序列，XM_表示预测的蛋白编码序列，NR_表示非编码蛋白的mRNA序列，AF开头的表示克隆序列，BC开头的表示模板序列，大家可以细细研究。 继续阅读
《自然》9月23日头条消息，美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所研究人员领导的国际研究小组，开发出一种高效的基因组改编方法，可对斑马鱼基因组进行精确定位的剪切替换。该研究首次实现了对斑马鱼基因组分的自定义修改。
这里所指的高效的基因组编辑工具就是TALENs。我觉得TALENs将会开启后基因组时代新的篇章，具有不可估量的应用价值。
原文：“In vivo genome editing using a high-efficiency TALEN system”
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